【國際戰“疫”行動】

科技日報訊 （實習記者張佳欣）據近日發表在《自然》雜誌上的論文，美國加州大學聖地亞哥分校和斯克利普斯研究所聯合開發了一種名爲“Freyja”的算法，用於在早期檢測廢水中的新冠病毒變異株，只需兩茶匙未經處理的污水，就可準確測定新冠病毒變異株。

斯克利普斯研究所研究人員開發了一個“條形碼”庫，可根據每個變異株特有的短RNA片段來識別新冠病毒變異株，並編寫了一種新算法，通過篩選廢水中的大量遺傳信息來匹配這些條形碼。由此生成的免費程序Freyja，已經被美國公共衛生機構廣泛用於廢水監測。

研究人員表示，在實驗室對廢水樣本進行測序後，只需運行Freyja，20秒就可得到結果。當研究人員將Freyja應用於廢水樣本並將結果與聖地亞哥市的臨牀數據進行比較時，他們發現該工具在臨牀報告前14天就在廢水中檢測出了“值得關切的變異株”，包括阿爾法、德爾塔和奧密克戎變異株。

2021年7月27日，研究人員在加州大學聖地亞哥分校的廢水中檢測到繆變異株9（B.1.621），這是在校園首次臨牀檢測的4周前檢測出來的。同年11月27日，該團隊還在聖地亞哥首次臨牀報告前11天檢測到廢水中的奧密克戎變異株。